MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 101682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003030	A	8	8	90	97	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003030	TACC	2	8	121	128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_003030	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003030	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003030	T	6	6	166	171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003030	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003030	T	10	10	230	239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003030	ATTA	2	8	246	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003030	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003030	T	6	6	352	357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003030	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003030	TTTA	2	8	428	435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003030	AAAT	2	8	436	443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003030	T	7	7	443	449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003030	AGG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003030	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
18	NC_003030	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
19	NC_003030	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
20	NC_003030	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
21	NC_003030	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893299
22	NC_003030	A	6	6	683	688	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
23	NC_003030	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
24	NC_003030	ACAA	2	8	755	762	75 %	0 %	0 %	25 %	15893299
25	NC_003030	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
26	NC_003030	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893299
27	NC_003030	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15893299
28	NC_003030	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15893299
29	NC_003030	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893299
30	NC_003030	TA	3	6	904	909	50 %	50 %	0 %	0 %	15893299
31	NC_003030	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
32	NC_003030	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
33	NC_003030	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
34	NC_003030	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893299
35	NC_003030	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893299
36	NC_003030	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	15893299
37	NC_003030	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
38	NC_003030	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	15893299
39	NC_003030	AACA	2	8	1178	1185	75 %	0 %	0 %	25 %	15893299
40	NC_003030	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15893299
41	NC_003030	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
42	NC_003030	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
43	NC_003030	AG	3	6	1397	1402	50 %	0 %	50 %	0 %	15893299
44	NC_003030	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	15893299
45	NC_003030	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
46	NC_003030	AACT	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	15893299
47	NC_003030	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
48	NC_003030	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
49	NC_003030	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
50	NC_003030	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
51	NC_003030	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893299
52	NC_003030	TC	3	6	1794	1799	0 %	50 %	0 %	50 %	15893299
53	NC_003030	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
54	NC_003030	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003030	TAT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003030	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003030	AGT	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003030	TAA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003030	T	7	7	1921	1927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003030	TTG	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003030	CAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003030	CTA	3	9	1983	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003030	TAC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003030	TAT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003030	TAA	2	6	2045	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003030	GGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003030	TAT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003030	A	7	7	2080	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	15893300
69	NC_003030	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
70	NC_003030	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
71	NC_003030	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15893300
72	NC_003030	AAAT	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	15893300
73	NC_003030	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
74	NC_003030	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893300
75	NC_003030	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
76	NC_003030	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
77	NC_003030	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
78	NC_003030	A	6	6	2455	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	15893300
79	NC_003030	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	15893300
80	NC_003030	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
81	NC_003030	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
82	NC_003030	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
83	NC_003030	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	15893300
84	NC_003030	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
85	NC_003030	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893300
86	NC_003030	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
87	NC_003030	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
88	NC_003030	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
89	NC_003030	AG	4	8	2855	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	15893300
90	NC_003030	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
91	NC_003030	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
92	NC_003030	AATA	2	8	2969	2976	75 %	25 %	0 %	0 %	15893300
93	NC_003030	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
94	NC_003030	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
95	NC_003030	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
96	NC_003030	AGG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003030	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003030	AAGT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	25 %	0 %	15893301
99	NC_003030	TA	3	6	3288	3293	50 %	50 %	0 %	0 %	15893301
100	NC_003030	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893301
101	NC_003030	AT	3	6	3348	3353	50 %	50 %	0 %	0 %	15893301
102	NC_003030	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003030	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
104	NC_003030	TA	3	6	3450	3455	50 %	50 %	0 %	0 %	15893302
105	NC_003030	A	6	6	3455	3460	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
106	NC_003030	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
107	NC_003030	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
108	NC_003030	A	6	6	3513	3518	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
109	NC_003030	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
110	NC_003030	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893302
111	NC_003030	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
112	NC_003030	A	7	7	3687	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
113	NC_003030	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
114	NC_003030	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
115	NC_003030	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
116	NC_003030	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893302
117	NC_003030	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893302
118	NC_003030	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
119	NC_003030	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
120	NC_003030	A	6	6	3948	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
121	NC_003030	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	15893302
122	NC_003030	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893302
123	NC_003030	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893302
124	NC_003030	ATTC	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	15893302
125	NC_003030	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893302
126	NC_003030	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
127	NC_003030	TTTA	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	15893302
128	NC_003030	AAAT	2	8	4243	4250	75 %	25 %	0 %	0 %	15893302
129	NC_003030	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893302
130	NC_003030	AT	4	8	4409	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	15893302
131	NC_003030	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
132	NC_003030	A	6	6	4484	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
133	NC_003030	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893303
134	NC_003030	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
135	NC_003030	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893303
136	NC_003030	GGAT	2	8	4677	4684	25 %	25 %	50 %	0 %	15893303
137	NC_003030	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
138	NC_003030	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
139	NC_003030	AGG	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003030	A	7	7	4851	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	15893304
141	NC_003030	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
142	NC_003030	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
143	NC_003030	GAT	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
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279	NC_003030	GAA	2	6	10649	10654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_003030	GGT	2	6	10724	10729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_003030	GTC	2	6	10738	10743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_003030	TCGTG	2	10	10747	10756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
283	NC_003030	GGA	2	6	10850	10855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_003030	ATC	2	6	10874	10879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_003030	AC	3	6	10901	10906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_003030	TGG	2	6	10916	10921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_003030	AC	3	6	11069	11074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_003030	CCT	2	6	11210	11215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_003030	TC	3	6	11289	11294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
290	NC_003030	TGT	2	6	11368	11373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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